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（社）自閉症協会本部の組織改編のため，平成20年4月1日より従来の都道府県支部は都道府県単位の自閉症協会へと名称が変更になりました。しばらくの間は移行期間として従来の名称も併記可能ですが，徐々に統一されることになります。
| 地域 | 名称 |
|---|---|
| 全国 | （社）日本自閉症協会 |
| 北海道 | 北海道支部札幌分会（札幌ぽぷら会） |
| 東北 | 福島県支部 |
| 関東 | 茨城県自閉症協会 栃木県自閉症協会 群馬県支部 埼玉県自閉症協会 千葉県自閉症協会 東京都支部 神奈川県自閉症協会 海老名市自閉症児・者親の会 |
| 中部 | 長野県（こぶしの会（中信地区）） NPO法人にいがた・オーティズム 静岡県支部 愛知県自閉症協会（つぼみの会） 富山県支部 石川県自閉症協会 福井県支部 岐阜県支部 |
| 近畿 | 三重県自閉症協会 滋賀県自閉症協会 京都府自閉症協会 大阪府支部 奈良県自閉症協会 和歌山県自閉症協会 兵庫県支部 |
| 中国 | 岡山県支部 岡山県自閉症児を育てる会 鳥取県支部 広島県支部 |
| 四国 | 香川県支部 高知県自閉症協会 愛媛県支部 |
| 九州・沖縄 | 福岡県支部 福岡市自閉症児者親の会 北九州市親の会 佐賀県支部 長崎県支部 熊本県自閉症協会 宮崎県自閉症協会 鹿児島県自閉症協会 沖縄県支部 |